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12月份国内新出的细胞外囊泡/外泌体领域论文不完全统计有325篇。IF>10的有67篇、IF>20的有6篇。本期主要内容包括:单细胞测序揭示不同类型细胞EVs分泌活性、循环EV衍生RNA预测转移性结直肠癌患者对一线化疗的反应、肝癌干细胞外泌体环状RNA、DNA纳米材料赋能的EV表面工程、糖尿病视网膜病变、糖尿病伤口愈合、脊髓损伤后神经再生、葡萄柚来源的EVs、个性化胶质母细胞瘤免疫治疗等方面内容。内容十分丰富,不容错过。全部文献列表及部分文章原文可在外泌体之家论坛同名贴下下载。
1.中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队:SEVtras通过单细胞测序揭示不同类型细胞的胞外小囊泡分泌活性He, R., et al. (2023). "SEVtras delineates small extracellular vesicles at droplet resolution from single-cell transcriptomes."小型细胞外囊泡(sEV)正在成为生理和病理过程中广泛的关键角色。然而,一个紧迫的挑战是缺乏能够揭示sEV的复杂异质性并解码控制sEV分泌的基础细胞行为的高通量技术。该研究利用基于液滴的单细胞RNA测序(scRNA-seq),并引入一种算法SEVtras来识别含有sEV的液滴并估计单个细胞的sEV分泌活性(ESAI)。通过对模拟和真实数据集的广泛验证,证明了SEVtras捕获含sEV的液滴和表征特定细胞类型的分泌活性的效果。通过将SEVtras应用于四个肿瘤scRNA-seq数据集,进一步说明了ESAI可以作为肿瘤进展的强有力指标,特别是在早期阶段。随着scRNA-seq数据集的重要性和可用性的不断提高,SEVtras有望提供有价值的细胞外洞察力,以了解细胞的异质性。
2.【综述】郑州大学胡军红等:细胞外囊泡重塑肿瘤免疫治疗的肿瘤环境Yue, M., et al. (2023). "Extracellular vesicles remodel tumor environment for cancer immunotherapy."Mol Cancer 22(1): 203.IF=37.3肿瘤免疫治疗已经改变了肿瘤疾病的治疗方式,但低反应率和免疫并发症仍然是主要挑战。包括外泌体在内的细胞外囊泡已成为治疗剂,积极参与各种病理条件。越来越多的证据表明,细胞外囊泡(EVs)的数量和组成的改变有助于重塑免疫抑制性肿瘤微环境(TME),从而影响免疫治疗的疗效。这一发现引起了临床上利用EVs进行免疫敏化的兴趣。该综述全面介绍了TME中各种EVs组分的起源、生成和相互作用。此外,还讨论了EVs在肿瘤发生过程中重塑TME的关键作用,以及它们的特定载体,如PD-1和非编码RNA,这些载体影响TME内关键免疫细胞的表型。此外,还总结了EVs在不同抗肿瘤疗法中的应用,工程EVs用于癌症免疫治疗的最新进展以及临床转化中遇到的挑战。鉴于这些发现,作者主张更广泛地了解EVs对TME的影响,因为这将揭示被忽视的治疗漏洞,并可能提高现有癌症免疫治疗的疗效。
3.复旦大学郭伟剑、黄胜林等:循环细胞外囊泡衍生RNA的液体活检特征可预测转移性结直肠癌患者对一线化疗的反应Yang, Y., et al. (2023). "A liquid biopsy signature of circulating extracellular vesicles-derived RNAs predicts response to first line chemotherapy in patients with metastatic colorectal cancer." Mol Cancer 22(1): 199. IF=37.3背景:结直肠癌(CRC)是世界上最具威胁的肿瘤之一,化疗仍然是转移性结直肠癌(mCRC)患者治疗的主要方法。本研究的目的是开发一个生物标志物组合,以预测mCRC患者一线化疗的反应。方法:共纳入了3个不同机构中接受FOLFOX或XEOLX化疗的190名mCRC患者。研究提取了血浆细胞外囊泡(EV)RNA,进行了RNA测序,通过随机森林算法和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)算法在训练队列(n = 80)中缩小变量数量,构建了一个模型并生成了一个组合特征。在内部验证队列(n = 62)和前瞻性外部验证队列(n = 48)中进行了验证。结果:建立了一个由22个EV RNA组成的组合特征,可以识别出响应者,接收器操作特征曲线(AUC)值在训练,内部验证和外部验证队列中分别为0.986、0.821和0.816。该组合特征还可以识别进展无病生存期(PFS)和总生存期(OS)。此外,构建了一个由7个基因组成的组合特征,可以预测肿瘤对含奥沙利铂的一线化疗的反应,并同时对含伊立替康的二线化疗产生抗药性。结论:该研究首次开发了一种EV衍生RNA组合特征,以非侵入性方法预测mCRC一线化疗的反应,表明该组合特征可以帮助选择最佳方案,以治疗mCRC患者。
4.中国医科大学附属第一医院李凯等:肝癌干细胞外泌体中的重要环状RNA——肝癌恶性增殖的介质Han, T., et al. (2023). "Significant CircRNAs in liver cancer stem cell exosomes: mediator of malignant propagation in liver cancer?" Mol Cancer 22(1): 197. IF=37.3肝细胞癌(HCC)是全球最普遍的癌症之一,是全球医疗保健面临的重大挑战。癌症干细胞(CSCs)可以影响邻近的非CSCs,被认为在肿瘤生长和耐药性方面发挥着关键作用,但具体的机制和介质尚未完全理解。调节CSC状态被认为是早期肿瘤形成和已建立的肿瘤中的理想治疗策略。类似于经典激素信号传导,外泌体已经成为细胞间通讯的关键角色,并且对于在肝癌中促进细胞间通讯至关重要。该研究通过耦合免疫磁珠分选和外泌体测序,发现富含肝癌 CSCs 的外泌体衍生的 circRNAs 是具有干细胞特性的关键子集,最终促进了HCC的发展。有趣的是,发现circ-ZEB1和circ-AFAP1与肝癌干细胞性和不良预后密切相关,并且可以调节上皮-间质转化(EMT)过程。新型外泌体衍生 circRNAs 在恶性传输的各种细胞间交流和通讯系统中起着至关重要的作用。这一发现不仅为利用血浆外泌体circRNAs作为HCC患者的临床预后指标提供了有价值的支持,而且还突出了探索肝CSCs与外泌体中的信使分子之间信号传导的新研究方向。
5.【综述】四川大学华西医院雷建勇团队:细胞外囊泡在循环肿瘤细胞介导的远处转移中的作用Guo, S., et al. (2023). "The role of extracellular vesicles in circulating tumor cell-mediated distant metastasis." Mol Cancer 22(1): 193.IF=37.36.中国科学院宁波材料技术与工程研究所王凯喆等:DNA纳米材料赋能的细胞外囊泡表面工程Yao, X., et al. (2023). "DNA Nanomaterial-Empowered Surface Engineering of Extracellular Vesicles." Adv Mater: e2306852. IF=29.4
7.江苏大学钱晖、许文荣团队:工程间充质干细胞衍生的小细胞外囊泡通过HIF-1α/EZH2/PGC-1α途径治疗糖尿病视网膜病变Sun, F., et al. (2024). "Engineered mesenchymal stem cell-derived small extracellular vesicles for diabetic retinopathy therapy through HIF-1α/EZH2/PGC-1α pathway." Bioact Mater 33: 444-459. IF=18.9糖尿病性视网膜病变(DR)是全球导致失明的主要原因之一,治疗选择有限。间充质干细胞来源的小型细胞外囊泡(MSC-sEVs)作为一种无细胞治疗方法,为视网膜疾病的治疗提供了希望。本研究提供证据表明,MSC-sEVs的玻璃体内注射改善了db/db小鼠和链脲佐菌素诱导的糖尿病大鼠的视网膜功能,并减轻了视网膜凋亡、炎症和血管生成。机制上,高血糖诱导的缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)的激活抑制了三分子结构域21(TRIM21)介导的增强子锌指蛋白同源物2(EZH2)的泛素化和降解,最终通过EZH2诱导的甲基化修饰导致过氧化物酶体增殖物激活受体-γ共激活因子-1α(PGC-1α)的下调。MSC-sEVs中miR-5068和miR-10228的存在靶向HIF-1α/EZH2/PGC-1α通路。miR-5068和miR-10228的阻断消除了MSC-sEVs的视网膜治疗效果。此外,通过提高miR-5068和miR-10228的水平来改进MSC-sEVs,以提高视网膜修复效率。总之,研究结果提供了DR进展机制的新见解,并突出了MSC-sEVs,特别是工程化的MSC-sEVs,作为DR治疗选择的潜力。
8.中南大学胡建中等:EGFR(+)NSCs衍生的外泌体的局部递送通过miR-34a-5p/HDAC6途径促进脊髓损伤后神经再生Qin, T., et al. (2024). "Local delivery of EGFR(+)NSCs-derived exosomes promotes neural regeneration post spinal cord injury via miR-34a-5p/HDAC6 pathway." Bioact Mater 33: 424-443. IF=18.9
9.复旦大学生物医学研究院商珞然:用于眼内药物递送的外泌体负载微载体Pan, M., et al. (2023). "Exosome-loaded microcarriers for intraocular drug delivery." Sci Bull (Beijing). IF=18.9
10.华中科技大学张英泽等:缺氧内皮细胞来源的外泌体通过改善内皮细胞功能和促进M2巨噬细胞极化促进糖尿病伤口愈合Cheng, P., et al. (2024). "Hypoxia endothelial cells-derived exosomes facilitate diabetic wound healing through improving endothelial cell function and promoting M2 macrophages polarization." Bioact Mater 33: 157-173.IF=18.9
11.南京大学孙凌云、东南大学赵远锦:仿生心脏纤维化芯片作为评估间充质干细胞衍生的外泌体疗法的可视化疾病模型Shang, Y., et al. (2023). "A Biomimetic Cardiac Fibrosis-on-a-Chip as a Visible Disease Model for Evaluating Mesenchymal Stem Cell-Derived Exosome Therapy."心脏纤维化是由于其在多种心脏疾病中的普遍性和与心力衰竭的基本联系而成为严重的全球性健康问题。考虑到干细胞治疗心脏纤维化的效率,人们已经致力于开发准确的模型来研究其潜在的治疗机制。该研究提出了一种基于Janus结构色膜(SCF)的精细仿生心脏纤维化芯片,以为干细胞治疗研究提供微观生理视觉。通过在Janus SCF上共培养心肌细胞(CM)和心脏成纤维细胞(FB)并诱导纤维化,该芯片可以重现纤维化微环境内的生理细胞间相互作用,阐明纤维化心脏的生理变化。特别地,Janus结构色膜具有优越的感知能力,可以捕捉和响应微弱的心脏力量,展示同步的结构色偏移。基于这些特点,不仅探索了颜色映射与评估的疾病表型之间的动态关系,还证明了心脏纤维化芯片的自报告能力,用于评估间充质干细胞来源的外泌体治疗。这些特点表明,这样的芯片有可能促进精准医学策略的发展,并创建一个用于临床前心脏药物筛选的方法。
12.哈尔滨工业大学(深圳)马星等:脲酶驱动的微电机具有酶的空间选择性分布,用于捕获和传感外泌体Liu, X., et al. (2023). "Urease-Powered Micromotors with Spatially Selective Distribution of Enzymes for Capturing and Sensing Exosomes." ACS Nano 17(23): 24343-24354. IF=18.6
13.南方医科大学区彩文&国家纳米科学中心梁兴杰:仿生葡萄柚来源的细胞外囊泡可安全、靶向地输送硫代硫酸钠以对抗血管钙化Feng, W., et al. (2023). "Biomimetic Grapefruit-Derived Extracellular Vesicles for Safe and Targeted Delivery of Sodium Thiosulfate against Vascular Calcification."ACS Nano 17(24): 24773-24789. IF=18.6随着血管钙化(VC)的普及率不断增加,VC成为心血管疾病发病率和死亡率的强有力因素,药物治疗的需求变得迫切。硫代硫酸钠(STS)是一种临床批准的VC治疗药物,但其生物利用度不佳和严重的不良反应影响了其疗效。植物源性细胞外囊泡提供了VC治疗的选择,因为它们可以用作生物模仿药物载体,具有比人工载体更高的生物安全性和靶向能力。受天然葡萄柚源性细胞外囊泡(EVs)的启发,制造了一种仿生纳米载体,其中包含负载STS的EVs,并进一步修饰了羟基磷灰石晶体结合肽(ESTP),以实现VC靶向输送STS。在体外,ESTP纳米药物表现出优异的钙化血管平滑肌细胞(VSMCs)细胞摄取能力,并随后抑制了VSMCs的钙化。在VC小鼠模型中,ESTP纳米药物相对于其他治疗组,显示出在钙化动脉中最高的积累。机制上,ESTP纳米药物通过驱动M2巨噬细胞极化,减少炎症和抑制骨-血管轴,从而显著预防了VC,同时抑制了VSMCs的成骨表型转分化,同时增强了骨质。此外,ESTP纳米药物不会引起溶血或对其他器官造成任何损害。这些结果表明,ESTP纳米药物可以成为一种有前途的VC药物,而不必担心系统毒性的问题。
14.复旦大学孙念荣等:用于膀胱癌早期筛查、亚型分型和随访评估的异质MXene杂交外泌体分离和代谢分析Chen, H., et al. (2023). "Heterogeneous MXene Hybrid-Oriented Exosome Isolation and Metabolic Profiling for Early Screening, Subtyping and Follow-up Evaluation of Bladder Cancer." ACS Nano 17(23): 23924-23935.IF=18.6
15.香港大学Judy Wai Ping Yam团队:NHE7上调通过促进肝细胞癌中巨脂质体的成熟来增强小细胞外囊泡的摄取Yao, Y., et al. (2023). "NHE7 upregulation potentiates the uptake of small extracellular vesicles by enhancing maturation of macropinosomes in hepatocellular carcinoma."Cancer Commun (Lond). IF=16.2
16.【综述】南方医科大学赵善超等:工程细胞外囊泡——肿瘤靶向治疗和克服耐药性的新方法Ming-Kun, C., et al. (2023). "Engineered extracellular vesicles: A new approach for targeted therapy of tumors and overcoming drug resistance." Cancer Commun (Lond). IF=16.2
17.上海交通大学余辉等:膜蛋白与细胞外囊泡和颗粒大小之间的相关性——癌症诊断的潜在特征Zhai, C., et al. (2023). "Correlation between membrane proteins and sizes of extracellular vesicles and particles: A potential signature for cancer diagnosis."J Extracell Vesicles 12(12): e12391. IF=16
18.南方医科大学的郑磊、王前和司徒博教授:循环细菌细胞外囊泡的单颗粒分析揭示了它们的生物发生、血液变化以及与肠道屏障的联系Ou, Z., et al. (2023). "Single-particle analysis of circulating bacterial extracellular vesicles reveals their biogenesis, changes in blood and links to intestinal barrier." J Extracell Vesicles 12(12): e12395. IF=16
19.第三军医大学徐海伟等:来自类器官来源的人视网膜祖细胞的细胞外囊泡通过调节脂肪酸代谢来预防脂质超负荷诱导的视网膜色素上皮损伤Gao, H., et al. (2024). "Extracellular vesicles from organoid-derived human retinal progenitor cells prevent lipid overload-induced retinal pigment epithelium injury by regulating fatty acid metabolism." J Extracell Vesicles 13(1): e12401. IF=16视网膜退化(RD)是一组导致不可逆视力损失的疾病,其特征为视网膜色素上皮(RPE)或视网膜神经元的损伤和丧失。干细胞分泌的细胞外囊泡(EV)具有更少的免疫排斥和肿瘤发生风险,为RD提供了一种新的无细胞治疗范式,但仍需进一步研究。人类视网膜器官衍生的视网膜祖细胞(hERO-RPCs)是一种易于获取和先进的RD治疗细胞来源。然而,hERO-RPCs衍生的EVs需要进一步表征。在深入的蛋白质组学分析的基础上,比较了hERO-RPCs(hRPC-EVs)和人类胚胎干细胞(hESC)衍生的EVs(hESC-EVs)的特性。EVs和它们各自的起源细胞之间的比较表明,hRPC-EVs的蛋白负载比hESC-EVs更具选择性。特别是,hESC-EVs富含与血管生成和细胞周期相关的蛋白质,而hRPC-EVs富含与免疫调节和视网膜发育相关的蛋白质。更重要的是,与hESC-EVs相比,hRPC-EVs的细胞增殖相关性更低,具有调节脂质代谢的独特能力。进一步证实,hRPC-EVs可能消除脂质沉积,抑制脂毒性和氧化应激,并增强油酸处理的ARPE-19细胞的吞噬作用和存活能力。机制上,hRPC-EVs被整合到油酸处理的ARPE-19细胞的线粒体网络中,并增加了线粒体脂肪酸β氧化相关蛋白质的水平。因此,器官衍生的hRPC-EVs代表了一种有前途的无细胞治疗RD的来源,特别是针对RPE细胞中异常脂质代谢相关的致盲性疾病。
20.武汉大学张先正团队:通过STING激活功能化的嵌合外泌体用于个性化胶质母细胞瘤免疫治疗Bao, P., et al. (2023). "Chimeric Exosomes Functionalized with STING Activation for Personalized Glioblastoma Immunotherapy." Adv Sci (Weinh): e2306336.IF=15.1现有癌症疫苗的一个关键挑战是协调抗原呈递细胞(APC)内富含抗原的供给和最佳抗原呈递功能的需求。该研究使用负载有干扰素基因刺激剂(STING) 激动剂 (DT-Exo-STING) 的树突状细胞 (DC)-肿瘤杂交细胞衍生的嵌合外泌体开发了一种补充免疫治疗策略,以最大限度地提高肿瘤特异性 T 细胞免疫。这些嵌合载体配备有广谱抗原复合物,可通过直接自我呈现和间接 DC-T 免疫刺激途径引发强大的 T 细胞介导的炎症程序。与现成的环二核苷酸(CDN)递送技术相比,这种嵌合外泌体辅助递送策略具有出色的组织归巢能力,甚至可以跨越棘手的血脑屏障(BBB),以及所需的细胞质进入能力。增强的 STING 激活信号传导。这种纳米疫苗驱动的 STING 激活改善了抗原呈递性能,进一步增强了肿瘤特异性T细胞免疫反应。因此,DT-Exo-STING 将免疫抑制性胶质母细胞瘤微环境逆转为促炎、杀肿瘤状态,导致颅内原发病变几乎消失。值得注意的是,利用自体肿瘤组织生产个性化 DT-Exo-STING 疫苗的升级选择可提高对免疫检查点阻断 (ICB) 治疗的敏感性,并发挥系统免疫记忆来防止术后神经胶质瘤复发。这些发现代表了胶质母细胞瘤免疫治疗的一种新兴方法,值得在临床领域进一步探索性发展。
21.中国人民解放军总医院唐佩福:破译免疫特征重塑揭示了肌肉和骨骼同步老化的潜在机制Yin, P., et al. (2023). "Deciphering Immune Landscape Remodeling Unravels the Underlying Mechanism for Synchronized Muscle and Bone Aging." Adv Sci (Weinh): e2304084. IF=15.1
22.空军军医大学屈延等:星形胶质细胞来源的细胞外囊泡miR-143-3p抑制内皮粘附分子的自噬降解并促进急性脑损伤后中性粒细胞跨内皮迁移Wu, X., et al. (2023). "Astrocyte-Derived Extracellular Vesicular miR-143-3p Dampens Autophagic Degradation of Endothelial Adhesion Molecules and Promotes Neutrophil Transendothelial Migration after Acute Brain Injury." Adv Sci (Weinh): e2305339. IF=15.1
23.哈尔滨医科大学王玉玞等:负载有改变的肽配体的树突状细胞衍生的小细胞外囊泡通过引发 CD4(+) T 细胞介导的神经保护性免疫作为脊髓损伤的治疗疫苗Wang, S., et al. (2023). "Small Extracellular Vesicles Derived from Altered Peptide Ligand-Loaded Dendritic Cell Act as A Therapeutic Vaccine for Spinal Cord Injury Through Eliciting CD4(+) T cell-Mediated Neuroprotective Immunity." Adv Sci (Weinh): e2304648. IF=15.1
24.第三军医大学陈林等:新型货物输送系统AnCar-Exo(LaIMTS)通过专门针对促炎性巨噬细胞来改善关节炎Li, S., et al. (2023). "A Novel Cargo Delivery System-AnCar-Exo(LaIMTS) Ameliorates Arthritis via Specifically Targeting Pro-Inflammatory Macrophages." Adv Sci (Weinh): e2306143. IF=15.1
25.海军军医大学:内皮衍生的工程细胞外囊泡在急性肺损伤中保护肺内皮屏障Gu, Z., et al. (2023). "Endothelium-Derived Engineered Extracellular Vesicles Protect the Pulmonary Endothelial Barrier in Acute Lung Injury." Adv Sci (Weinh): e2306156. IF=15.1
26.【综述】四川大学华西医院陈婵等:细胞外囊泡——COVID-19中枢神经病理学的隐形英雄和恶棍Chang, H., et al. (2023). "Extracellular Vesicles: The Invisible Heroes and Villains of COVID-19 Central Neuropathology." Adv Sci (Weinh): e2305554. IF=15.1如需全部文献列表及部分文章原文,请至外泌体之家论坛同名贴下载。(搜索:外泌体之家;或网址:www.exosome.com.cn)
以上,12月份国内细胞外囊泡/外泌体领域研究进展的月总结整理。感谢大家关注!愿有所收获。下个月见!
【关于华龛生物】
北京华龛生物科技有限公司成立于2018年,由清华大学医学院杜亚楠教授科研团队领衔创建,清华大学参股共建。核心技术源于清华大学科技成果转化,并凭借此项技术荣登中国科协“科创中国”先导技术榜。作为国家级高新技术企业、国家级专精特新“小巨人”企业、潜在独角兽企业,更获得国家科技部多项重点研发专项支持。
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华龛生物的产品与服务,已广泛应用于基因与细胞治疗、细胞外囊泡、疫苗及蛋白产品等生产的上游工艺开发。同时,在再生医学、类器官与食品科技(细胞培养肉等)领域也具有广泛应用前景。并且,目前已助力多家细胞与基因治疗企业进行IND申报。
华龛生物拥有5000平米的研发与转化平台,其中包括1000余平的以3D细胞智造及微组织再生医学治疗产品为核心的CDMO服务平台;以及4000平米的GMP生产平台,并新建了1200L微载体生产线。此外还在上海设有2000余平的国际合作与技术应用中心,以技术创新持续融入全球生物产业新业态。